Kamijo è uno studente della Città Accademia, dove le persone usano la scienza per sviluppare abilità soprannaturali. Il ragazzo ha molto cuore, fortunatamente per una giovane suora di nome Index. È in fuga da una società di stregoneria che brama gli incredibili 103.000 volumi di conoscenza magica conservati nella sua memoria. Quando Index si imbatte nella vita di Kamijo, trova un fedele amico e protettore, e sebbene Kamijo sia senza dubbio il ragazzo più debole della Città Accademia, ha qualcos'altro a suo favore: l'Imagine Breaker, un potere inspiegabile immagazzinato nella sua mano destra che nega i poteri di altri. Con scienziati e stregoni che attaccano da tutte le parti, l'Imagine Breaker tornerà sicuramente utile, ma è la lealtà di Kamijo verso Index la sua arma più potente nella lotta per tenerla al sicuro.