In un mondo in cui esistono sia uomini che mostri. Coloro che danno la caccia ai mostri sono chiamati Cacciatori. Ma in un piccolo angolo del mondo del Cacciatore, ci sono quelli chiamati Cavalieri che si legano e convivono con i mostri. Con le loro Kizuna Ishi (Pietre di Legame) che permettono loro di risvegliare il potere nascosto nei mostri, i Riders vivono in segreto insieme ai loro Otomon, i mostri con cui hanno stretto una connessione. Ryuto, un ragazzo che vive nel villaggio dei cavalieri di Hakum, sogna di diventare il miglior cavaliere del mondo. Avendo appena compiuto 12 anni, decide di trovare il proprio Otomon prima della cerimonia in cui gli viene consegnato il suo Kizuna Ishi. Insieme al suo amico d'infanzia di buon cuore Cheval, alla sua curiosa amica d'infanzia Lilia e al suo compagno Naville, si addentra nel profondo della foresta e ha un incontro miracoloso con un Rathalos.