Ambientato negli anni '60, lo studente liceale Toru Watanabe perde il suo unico amico Kizuki dopo essersi suicidato. Toru, ora alla ricerca di una nuova vita, entra in un'università a Tokyo. Per caso, Toru incontra l'ex fidanzata di Kizuki, Naoko, all'università. Si avvicinano perché entrambi condividono la stessa perdita. Man mano che Toru e Naoko si avvicinano ancora di più, cresce anche il senso di perdita di Naoko. Dopo il ventesimo compleanno di Naoko, parte per un sanatorio a Kyoto. Watanabe, devastato dalla situazione, incontra la sincera Midori durante il semestre primaverile. Midori sembra un piccolo animale appena venuto al mondo...