MISSILE segue il 4315th Training Squadron dello Strategic Air Command presso la base aeronautica di Vandenberg in California, dove gli ufficiali dell'aeronautica vengono addestrati a presidiare i centri di controllo del lancio dei missili balistici intercontinentali Minuteman. Le sequenze includono la discussione delle questioni morali e militari della guerra nucleare; l'armamento, il puntamento e il lancio del missile; codici; comunicazioni; protezione contro gli attacchi terroristici; procedure di emergenza; riunioni del personale e sessioni di tutorial.