Brendan è un pastore in una piccola chiesa evangelica e ha un segreto. Non crede più in Dio. Sua moglie è ancora una vera credente e l'ha detto alla persona sbagliata. Losing Our Religion è un lungometraggio documentario sui predicatori che non sono credenti e su cosa fanno gli atei quando non vanno in chiesa. Con accesso consentito ai 600 membri del The Clergy Project - un rifugio sicuro per predicatori di tutte le fedi che non credono più - il documentario segue gli ex membri e il clero che sono ancora sotto copertura. Non stanno solo perdendo la religione, per molti stanno perdendo anche gli amici, la comunità e perfino la famiglia. Così come il loro lavoro. Mentre si svolgono eventi che cambiano la vita per sempre, le loro storie si collegano anche a comunità secolari che stanno crescendo in luoghi sorprendenti. Nuovi gruppi stanno sperimentando modi per avere una chiesa senza Dio e ponendo la stessa domanda del clero non credente: "qual è il prossimo?"