Con il riemergere dei Gyaos, i legami di Gamera con l'umanità sono stati recisi e il suo legame con Asagi spezzato. Nagamine e Asagi indagano mentre una ragazza orfana di nome Ayana scopre una nuova creatura che chiama Iris. Nagamine e Asagi devono raggiungere Ayana prima che lei si vendichi di Gamera, che incolpa per la morte della sua famiglia.