Dopo l'apertura di una scuola misteriosa dall'altra parte della strada, gli studenti della Super Hero High si ritrovano a dover affrontare una nuova minaccia. Ora, Wonder Woman, Supergirl, Batgirl e il resto delle DC Super Hero Girls non devono solo preoccuparsi del benessere dei loro voti, ma della sicurezza e dell'incolumità degli amici, della famiglia e del resto della civiltà. Le ragazze devono capire come fermare questo nuovo rivale malvagio che attraversa la città e salvare il mondo ancora una volta