Freedom Uncut racconta il periodo tumultuoso - ma creativamente fruttuoso - della vita e della carriera di Michael dopo l'uscita del suo debutto solista nel 1987, Faith, poi attraverso la creazione e l'uscita del suo seguito del 1990 Listen Without Prejudice, Vol. 1. Oltre a documentare i suoi sforzi creativi durante questo periodo, il documentario esplorerà anche la sua relazione con Anselmo Feleppa - morto per complicazioni legate all'AIDS - così come la morte della madre di Michael.