Le abilità di elettromanipolazione di Misaka – e la mossa deliziosamente distruttiva dei proiettili Railgun – la rendono una rock star nella Città Accademia. La tecno-metropoli è piena di studenti dotati di poteri soprannaturali conosciuti come esper, tra cui la civettuola amica e coinquilina di Misaka, Kuroko. Usa le sue capacità di teletrasporto come membro della squadra delle forze dell'ordine di Judgment, combattendo il crimine insieme al suo collega agente Uiharu. Insieme al loro amico Saten, un coraggioso esperto di livello 0, Misaka, Kuroko e Uiharu si divertono tantissimo ad affrontare il pericolo ogni volta e ovunque si presenti. Fortunatamente, in una città piena di bande dotate di superpoteri, scienziati pazzi e occasionalmente strani mostri, le ragazze non hanno problemi a trovare un sacco di eccitazione, azione e avventura! Dal regista di Toradora!, fai un altro viaggio esplosivamente divertente nel mondo di A certain Magical Index con A certain scientific railgun!